Paloittele kasvikset noin 2 cm:n paksuisiksi, tasakokoisiksi kuutioiksi. Kuullota sipulit ja munakoisot oliiviöljyssä. Lisää muut aineet joukkoon ja hauduta kannen alla noin 30 minuuttia alhaisella lämmöllä välillä sekoittaen.
Ratatouillen voi tarjoilla sellaisenaan joko kuumana tai kylmänä, mutta se sopii hyvin myös grillatun kalan tai lihan lisukkeeksi.